SiteMapは蛋白質立体構造からその表面の特性を解析し、活性部位となり得る領域を予測します。

Site Pointをグリッド状に配置し仮想的にリガンド分子を表現することにより、蛋白質との相互作用を高精度に評価します。計算された表面特性は水素結合ドナーおよびアクセプター、疎水性、親水性、金属作用領域に分類されます。

The protein surface for 1ett and the active site hydrophobic regions calculated by SiteMap

【参考文献】: - Halgren, T., "New Method for Fast and Accurate Binding-site Identification and Analysis", Chem. Biol. Drug Des., 2007, 69, 146-148.
【稼動環境】 Linux： OS RHEL 3.0 or 4.x, SUSE 9.0, SUSE SLED 9 or 10, CentOS 4.x, Red Hat Linux 7.3 or 9.0 Hardware x86-compatible processor, AMD, K6, Athlon, Opteron

Linux：	OS	RHEL 3.0 or 4.x, SUSE 9.0, SUSE SLED 9 or 10, CentOS 4.x, Red Hat Linux 7.3 or 9.0
Linux：	Hardware	x86-compatible processor, AMD, K6, Athlon, Opteron