MCPRO+はペプチド、蛋白質、核酸等の生体分子を対象としたMonte Carloシミュレーションを行うプログラムです。米国Yale大学のProf. Bill Jorgensenらによって開発されたMCPROをMaestroに組み込むことにより、これまで修練された技術と膨大な作業を必要としたインプット構造の準備や計算設定、ジョブのモニタリングを最適に行うGUI環境が実現されています。
Monte Carloシミュレーションを用いた構造最適化計算に加え、linear response法による結合自由エネルギー計算や自由エネルギー摂動法(FEP)による結合自由エネルギー変化予測まで幅広い機能を搭載しております。
- 【稼動環境】
Linux： OS RHEL 3.0 or 4.x, SUSE 9.0, SUSE SLED 9 or 10, CentOS 4.x, Red Hat Linux 7.3 or 9.0 Hardware x86-compatible processor, AMD, K6, Athlon, Opteron
創薬分子設計ソリューション SCHRÖDINGER Suite
配座探索プログラム MacroModel
高速量子計算プログラム Jaguar
高速・高精度ドッキングプログラム Glide
結合自由エネルギー計算プログラム Liaison
QM/MM計算プログラム QSite
蛋白質立体構造予測プログラム Prime
Pharmacophore 3D-QSAR解析プログラム Phase
3次元構造自動発生プログラム LigPrep
ADME物性予測計算プログラム QikProp
統計解析・化合物類似性評価プログラム Strike
コンビナトリアルライブラリ自動構築・自動ドッキングプログラム CombiGlide
pKa予測・イオン化モデル自動発生プログラム Epik
蛋白質活性部位予測プログラム SiteMap
蛋白質X線結晶構造精密化プログラム PrimeX
生体分子向けモンテカルロシミュレーションプログラム MCPRO+
SCHRÖDINGER社製品統合インターフェース Maestro
Induced Fitドッキング解析ソリューション Induced Fit Docking
蛋白質-リガンド間ディスクリプタ計算ソリューション Ligand & Structure-Based
Descriptors
QMドッキング解析ソリューション QM-Polarized Ligand Docking
