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製品イメージ

MKC-442, a non-nucleoside inhibitor in clinical trials for the treatment of HIV/AIDS binding to the HIV-1RT active site.

タンパク質-リガンド間の相互作用に関する情報を計算するLiaison, eMBrAcE Energy Difference Mode(MacroModel)およびMM-GBSA(Prime), リガンドに関するディスクリプタを発生させるQikPropおよびLigparse等の製品・機能を統合し、対象とする系に対して複数のシミュレーションを同時に実行するLigand & Structure-Based Descriptorsソリューションを実現しています。

また、統計解析/化合物類似性評価プログラムStrikeを利用することにより、発生した化学的なディスクリプタからインタラクティブにQSARモデルの作成やデータ解析を行うことが可能となります。


eMBrAcE Energy Difference Mode(MacroModel)

eMBrAcE_Energy Difference Energy DE = EComplex - (EReceptor + ELigand )を計算

MM-GBSA(Prime)

Free Energy of Binding DGBinding = GComplex - (GReceptor + GLigand )を計算

QikProp

分子全体の3次元構造に基づき、薬物物性を高速に計算、評価

Ligparse(LigPrep)

リガンド構造の構成原子、フラグメント情報を抽出

【稼動環境】
Linux: OS RHEL 3.0 or 4.x, SUSE 9.0, SUSE SLED 9 or 10, CentOS 4.x, Red Hat Linux 7.3 or 9.0
Hardware x86-compatible processor, AMD, K6, Athlon, Opteron

創薬分子設計ソリューション SCHRÖDINGER Suite
配座探索プログラム MacroModel
高速量子計算プログラム Jaguar
高速・高精度ドッキングプログラム Glide
結合自由エネルギー計算プログラム Liaison
QM/MM計算プログラム QSite
蛋白質立体構造予測プログラム Prime
3次元構造自動発生プログラム  LigPrep
ADME物性予測計算プログラム QikProp
Pharmacophore 3D-QSAR解析プログラム Phase
統計解析・化合物類似性評価プログラム Strike
コンビナトリアルライブラリ自動構築・自動ドッキングプログラム CombiGlide
pKa予測・イオン化モデル自動発生プログラム Epik
蛋白質活性部位予測プログラム SiteMap
蛋白質X線結晶構造精密化プログラム PrimeX
生体分子向けモンテカルロシミュレーションプログラム MCPRO+
SCHRÖDINGER社製品統合インターフェース Maestro
Induced Fitドッキング解析ソリューション Induced Fit Docking
蛋白質-リガンド間ディスクリプタ計算ソリューション Ligand & Structure-Based Descriptors
QMドッキング解析ソリューション QM-Polarized Ligand Docking

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