Pseudospectral法アルゴリズムを搭載した量子計算プログラムです。
今までの量子計算プログラムでは現実的ではなかった、より大きな分子や遷移金属を含む系に対しても高速かつ高精度な計算を実現します。また、JaguarにはpKa値を非経験的に自動算出するpKa計算機能(オプション）も搭載、高精度なpKa値予測を可能にします。計算化学を初めて行う人から上級者の方まで幅広いニーズに対応する優れた操作環境を提供します。
Transition state calculations of Jaguar converge quickly and reliably.
Jaguar’s unique transition metal initial guess makes it possible to accurately predict structures and vibrational frequencies that are in excellent agreement with experiment for systems like the siloxane cluster on a gold surface.
Acetohydroxamic acid is complexed to the zinc ion and the Glu-406 residue in the TACE active site.
- STO-3G, 3-21G, 4-21G, 6-21G, 4-31G, 6-31G, 6-311G, 6-311G-3DF-3PD, 6-31G(TM), M6-31G(TM), MIDI!, ERMLER2, D95V, D95VMQM, D95, D95MQM, MSV,cc-pVDZ, cc-pVTZ, cc-pVQZ, cc-pVTZ-pp, LAV1S, LAV2D, LAV2P, LAV3D, LACVD, LACVP, LACV3P, TZV, CSDZ (for Lanthanides), including f functions, with polarization and diffuse function options
- Effective core potential (ECP: Hay-Wadt ECPs, Cundari-Stephens ECPs )
- Pseudospectral法, all-analytical法，DIIS法, GVB-DIIS法, OCBSE法
- HF (RHF, ROHF, UHF, CPHF)法, LMP2法
- DFT法: RODFT/UDFT法
- B3P86, B3LYP, B3P86, B3PW91, B97-1, B98, SB98, BHandH, BHandHLYP, BLYP, BPW91, BP86, BP86-VWN5, PWP91, PBE, HCTH407, SVWN, SVWM5, Hartree-Fock-Slater, Xalpha, X3LYP, MPW1K, MPW1PW91
- GVB法, GVB-RCI法, GVB-LMP2法, GVB-DFT法
- 1点エネルギー計算, 構造最適化計算
- 基準振動解析計算（SQM法，赤外吸収強度，同位体効果，熱化学特性）
- 遷移状態構造最適化計算，遷移状態構造探索機能, IRC計算
- Relaxed Coordinate Scan計算, Rigid Coordinate Scan計算
- 励起状態計算: CIS法
- 高精度エネルギー法: J2 theory (Jaguar 2)
- 溶媒和計算： Jaguar Poisson-Boltzmann SCRF法
- Babel：ファイル変換ユーティリティー
- NBO：Natural Bond Orbital解析ユーティリティー
- JAGUAR Batch Scriptによる計算の自動化機能
- 並列計算 （MPIを利用）
- NMR遮蔽定数計算機能
- pKa自動計算機能（オプション）
- 【参考文献】
- - Rim, K.T.; Muller,T.; Fitts, J.P.; Adib, K.; Camillone, N.; Osgood, R.M.; Batista, E. R.; Friesner, R. A. ; Joyce, S. A.; Flynn, G. W., "Scanning tunneling microscopy and theoretical study of competitive reactions in the dissociative chemisorption of CCl4 on iron oxide surfaces", J. Phys. Chem. B., 2004, 108, 16753-16760.
- - Dukovic, G.; White, B. E.; Zhou, Z. Y.; Wang, F.; Jockusch, S.; Steigerwald, M. L.; Heinz, T. F.; Friesner, R. A.; Turro, N. J.; Brus, L. E,, "Reversible surface oxidation and efficient luminescence quenching in semiconductor single-wall carbon nanotubes", J. Am. Chem. Soc., 2004, 126, 15269-15276.
- - Zhou, Z.; Steigerwald, M.; Hybertsen, M.; Brus, L.; Friesner, R. A., "Electronic Structure of Tubular Aromatic Molecules derived from the Metallic (5,5) Armchair Single Wall Carbon Nanotube", J. Am. Chem. Soc., 2004, 126, 3597-3607.
- - Kaminski, G. A.; Stern, H. A.; Berne, B. J.; Friesner, R. A., "Development of an Accurate and Robust Polarizable Molecular Mechanics Force Field from Ab Initio Quantum Chemistry", J. Phys. Chem. A, 2004, 108, 621-627.
- - Hayes, JM; Stein, M; Weiser, J., "Accurate calculations of ligand binding free energies: Chiral separation with enantioselective receptors", J. Phys. Chem. A, 2004, 108, 3572-3580.
- - Dukovic, G.; White, B. E.; Zhou, Z. Y.; Wang, F.; Jockusch, S.; Steigerwald, M. L.; Heinz, T. F.; Friesner, R. A.; Turro, N. J.; Brus, L. E,, "Reversible surface oxidation and efficient luminescence quenching in semiconductor single-wall carbon nanotubes", J. Am. Chem. Soc., 2004, 126, 15269-15276.
- 【稼動環境】
* MaestroはLinux, Windowsのみ対応Linux： OS RHEL 3.0 or 4.x, SUSE 9.0, SUSE SLED 9 or 10, CentOS 4.x, Red Hat Linux 7.3 or 9.0 Hardware x86-compatible processor, AMD, K6, Athlon, Opteron Windows: OS Windows XP (Home or Pro version), Windows 2000 SP4 with Update Rollup 1
創薬分子設計ソリューション SCHRÖDINGER Suite
配座探索プログラム MacroModel
高速量子計算プログラム Jaguar
高速・高精度ドッキングプログラム Glide
結合自由エネルギー計算プログラム Liaison
QM/MM計算プログラム QSite
蛋白質立体構造予測プログラム Prime
Pharmacophore 3D-QSAR解析プログラム Phase
3次元構造自動発生プログラム LigPrep
ADME物性予測計算プログラム QikProp
統計解析・化合物類似性評価プログラム Strike
コンビナトリアルライブラリ自動構築・自動ドッキングプログラム CombiGlide
pKa予測・イオン化モデル自動発生プログラム Epik
蛋白質活性部位予測プログラム SiteMap
蛋白質X線結晶構造精密化プログラム PrimeX
生体分子向けモンテカルロシミュレーションプログラム MCPRO+
SCHRÖDINGER社製品統合インターフェース Maestro
Induced Fitドッキング解析ソリューション Induced Fit Docking
蛋白質-リガンド間ディスクリプタ計算ソリューション Ligand & Structure-Based
Descriptors
QMドッキング解析ソリューション QM-Polarized Ligand Docking
