タンパク質複合体の活性部位は結合リガンドによる誘導適合（induced fit)により大きな構造変化を生じます。X結晶構造解析によるこの問題の解析アプローチでは多大な時間の投資を必要するだけでなく解析できないケースも多く存在します。

Induced-FitプロトコルはGlideとタンパク質立体構造予測プログラムPrimeの組合わせにより、リガンドの網羅的な結合モード探索と、その結合状態により誘導される活性サイトでの構造変化を高精度に予測することで、この問題を解決致します。全てのプロセスをGUIから全自動化するInduced-Fitプログラムを搭載し、側鎖構造予測やLoopサーチ等多くの計算ステップを必要とした計算プロトコルを簡単かつ短時間に解析することが可能です。

【稼動環境】

Linux：	OS	RHEL 3.0 or 4.x, SUSE 9.0, SUSE SLED 9 or 10, CentOS 4.x, Red Hat Linux 7.3 or 9.0
Linux：	Hardware	x86-compatible processor, AMD, K6, Athlon, Opteron

創薬分子設計ソリューション　SCHRÖDINGER Suite
配座探索プログラム　MacroModel
高速量子計算プログラム　Jaguar
高速・高精度ドッキングプログラム　Glide
結合自由エネルギー計算プログラム　Liaison
QM/MM計算プログラム　QSite
蛋白質立体構造予測プログラム　Prime
Pharmacophore 3D-QSAR解析プログラム　Phase
3次元構造自動発生プログラム　 LigPrep
ADME物性予測計算プログラム　QikProp
統計解析・化合物類似性評価プログラム　Strike
コンビナトリアルライブラリ自動構築・自動ドッキングプログラム　CombiGlide
pKa予測・イオン化モデル自動発生プログラム　Epik
蛋白質活性部位予測プログラム　SiteMap
蛋白質X線結晶構造精密化プログラム　PrimeX
生体分子向けモンテカルロシミュレーションプログラム　MCPRO+
SCHRÖDINGER社製品統合インターフェース　Maestro
Induced Fitドッキング解析ソリューション　Induced Fit Docking
蛋白質-リガンド間ディスクリプタ計算ソリューション　Ligand & Structure-Based Descriptors
QMドッキング解析ソリューション　QM-Polarized Ligand Docking