Home  >  製品情報  >  BioNumerics^TM

BioNumericsは、1次元及び2次元電気泳動画像をはじめとし、酵素活性テストパネル、塩基配列などの
生物学実験を通して得られる、様々なデータをデータベース化し、分類・解析・同定を行う統合ソフトウェアです。

BioNumericsは、特に微生物の系統分類・食品などの品質管理に優れ、各国の研究機関に導入されて
高く評価されています。

BioNumericsの主な特徴

• 1次元及び2次元電気泳動画像を編集し、多彩な解析を行います。
• 電気泳動画像の他にも、様々な生物学実験データを実験サンプルごとに管理し、リレーショナルデータベースを作成します。1データベースにつき、最大20万サンプル、最大100情報フィールドの入力が可能です。
• 統計学に基づいた多彩な解析機能を搭載しています。実験サンプルごとの比較・解析を容易に行うことが出来ます。また、複数の実験データを統合し、解析することが可能です。
• データベースから既知の実験サンプルごとにデータライブラリを作成することにより、未知の実験サンプルを比較し、同定することが出来ます。
• ネットワーク経由でデータ共有が可能で、複数の研究室や大規模プロジェクトの解析ツールとしても利用できます。

BioNumericsの主なデータ取り込み機能

取り込み可能実験データ

• 電気泳動画像（1次元/2次元）
• 各種クロマトグラフィー、質量分析データ
• キャラクタデータ、マイクロアレイ
• 核酸、アミノ酸配列　など

実験データの編集

• 1次元電気泳動画像データ
  • レーンの自動検索及びデータ領域の設定
  • マーカー及び各レーンに共通なバンドを用いた画像標準化
  • バンドの自動検出
  • バンドの定量化
• 2次元電気泳動画像データ
  • スポットの自動検出及びマニュアル編集
  • 共通なスポットによる画像標準化
  • 自動スポットマッチング
  • スポット濃度の定量化
• シーケンスデータ
  • 核酸/アミノ酸配列のマニュアル編集
  • 波形データの編集/比較/コンティグ構築
  • マルチプルアラインメント

BioNumericsの主なデータ解析機能

統計解析

• 系統樹解析（UPGMA, Ward, Single Linkage, Neighbor Joining）
• 多変量解析（MDS, SOM, PCA, DA）
• 評価ツール（Bootstrap, Jackknife など）
• 統計（Chi-square test, T-test, Pearson Correlation test, Spearmann rank-order など）

合成データセットによる解析

各実験データの融合または各実験データの相同性の平均化による、全体の相同性の計算キャラクタ数またはユーザー定義によるデータ間の重み付け

サンプルデータの同定

マルチライブラリシステムを利用した、特徴的な同定ライブラリの作成と、新規実験データとライブラリとの比較による推定

【参考文献】

Applied Maths社ホームページのリスト参照
http://www.applied-maths.com/references/articles_bn.htm

【稼動環境】

OS: Windows 2000/XP

メモリ：128MB以上

T-RFLPデータ解析　MicrobiotaProfiler
遺伝子発現解析　GeneMaths XT